A preocupação ambiental é uma constante para a EMS, que possui uma política rígida de Saúde, Segurança e Meio Ambiente (SSMA). Por meio de um Sistema de Gestão Ambiental sólido e sustentável, mantém um sistema de gerenciamento de resíduos e uma estação de tratamento de esgotos sanitários e dos efluentes industriais (ETE) gerados pelos processos produtivos. A empresa tem Sistema de Gestão Ambiental – SGA certificado pela Norma ISO 14001. Em 2014, a EMS recebeu o Certificado de Carbono Neutro, referente à produção de embalagens, contribuindo para o plantio de 3.733 árvores.
A EMS mantém, ainda, parcerias para o descarte correto de medicamentos e para a preservação da floresta amazônica.